Året är 2029. Inopererad elektronisk utrustning, Cyborgs och elektroniska hjärnor är vardagsmat. Invånarna kan lätt koppla upp sin hjärna på det globala nätverket och hämta information. Men detta har öppnat för en ny typ av brottslighet: den digitala. Major Motoko, en cybernetisk människa, har i uppdrag att fånga en känd brottsling; en hacker som har lärt sig att hacka sig in i uppkopplade människors hjärnor och programmera om dom.