En pojke med livlig fantasi konfronteras med sina rädslor på en oförglömlig resa genom natten tillsammans med sin nya vän – en enorm, leende varelse som heter Mörker.

Pingvinerna Skepparn, Kowalski, Rico och Basse ger sig ut på ett superhemligt uppdrag för att stoppa den ondskefulle dr Octavius Bläcks planer på världsherravälde. De samarbetar med underrättelsetjänsten Nordanvinden, som leds av agent Hemlig (vi kan säga hans namn men då måste vi... ja, ni vet).

Ett nytt hot dyker upp och försätter både Fågelön och Grisön i fara. Red, Chuck, Bomb och Mäktiga Örnen rekryterar Chucks syster Silver och förenar sig med sina värsta ovänner, grisarna, för att tillsammans rädda sina hem.