Douglas Freeman är en CIA-analytiker boende i Nordafrika som tvingas ifrågasätta sitt uppdrag efter att ha sett det brutala och tvivelaktiga förhöret av en egyptisk-amerikansk man som utförs av den nordafrikanska hemliga polisen. Filmen berättar också om Anwar El-Ibrahimi, den egyptisk-amerikanske kemiingenjören vars familj emigrerade till USA när han var liten pojke och som nu misstänks vara terrorist, hans gravida hustru Isabella El-Ibrahimi som gör allt i sin makt för att hitta sin försvunne make, den make som tycks ha försvunnit under en flygning.

Inuti en stridsvagn möter fyra unga soldater för första gången krigets brutala verklighet. Vad som till en början liknade ett enkelt rutinuppdrag, blir snabbt en klaustrofobisk dödsfälla, där soldaterna får kämpa för att inte förlora sig själva i krigets kaos. Med endast ett kikarsikte som kontakt med yttervärlden och det öronbedövande kanonmullret utanför kommer "Lebanon" närmare krigets verklighet än någon annan krigsfilm tidigare gjort.