Allt han ville var att försvinna. Istället jagas Jason Bourne av människorna som gjorde honom till den han är. Han har förlorat både sitt minne och den han älskade mest. Nu kan inte ens en ny generation av yrkesmördare och deras vapen avskräcka honom att finna svaret på gåtan: vem han en gång var.

John Sands är hemlig agent och arbetar för en undergrupp inom det amerikanska flygvapnet. När hans egen byrå känner sig hotad av att han fått ta del av för mycket information under tidigare uppdrag bestämmer de sig för att låsa in honom och raderar hans minne, vilket leder till att John tvingas fly från ett högteknologiskt häkte. Men de hinner snart ikapp honom och ger honom ett erbjudande han inte kan motstå: att återföra ett stulet, topphemligt stealthplan till amerikanskt luftrum och därigenom återfå sin frihet. Om han misslyckas, kommer stealthplanet att hamna i händerna på terrorister som planerar att utrusta det med biologiska stridsspetsar. Det blir en kamp mot klockan, där Sands infiltrerar fienden och tar striderna mot nya höjder i en våldsam luftduell för att återfå sitt liv och rädda världen!

1997 omkom prinsessan Diana i en bilolycka i Paris. Drottning Elizabeth av Storbritannien får beskedet mitt i sitt första möte med den nyinsatte premiärministern Tony Blair. The Queen följer spänningarna inom politiken och mellan människorna som drabbades personligen. Drottning Elizabeth och premiärminister Tony Blair slits i en kamp mellan kungafamiljens ytterst personliga tragedi å ena sidan och allmänhetens krav på ett offentligt bevis på deras sorg å andra sidan.