Café de Flore handlar om människor åtskilda av tid och rum, men förenade på mystiska sätt. Filmen handlar om två parallella öden: Jacqueline, en ung mor med en son med Downs syndrom i 1960-talets Paris och Antoine, en nyligen frånskild, framgångsrik DJ i nutidens Montreal. Jacqueline och hennes sons historia visar sig i drömmarna hos Carole, Antoines nyblivna exfru.

Kriminalpolisen Hazel Micallef har vanligtvis inte särskilt mycket att oroa sig för i småstaden Port Dundas. Men när hon finner en äldre dam brutalt mördad, är detta bara början av en serie hemska mord på den omgivande landsbygden.