När Jake hittar ledtrådar till ett mysterium som spänner över tid och rum upptäcker han en hemlig plats som kallas Miss Peregrines hem för besynnerliga barn. När Jake lär sig mer om de boende där och deras besynnerligheter inser han att säkerheten är en illusion och att faran lurar som en mäktig och dold fiende. Jake måste lista ut vem som är verklig, vem han kan lita på och vem han verkligen är.

Det är maj 1945, andra världskriget är slut och över hela världen firar människor. London svämmar över av glädjeyra och två tonårssystrar tillåts för första gången själva ge sig ut i natten och de hamnar i ett fantastiskt äventyr. Glädjeruset gör att de kommer hem för sent… Hemma är Buckingham Palace och tonåringarna är prinsessan Margaret och hennes syster, blivande drottningen av England, Elizabeth II.