På heder och samvete är i huvudsak en dramaserie med omväxlande inslag av rättegångsdrama, action-scener och såpopera. Huvudpersonen i serien är Harmon Rabb, Jr., som innan seriens början var en hangarfartygsbaserad stridspilot i flottan som efter olycka togs ur flygtjänst på grund av nattblindhet. Rabb vidareutbildade sig till jurist, och i seriens pilotavsnitt återfick han sina vingar efter en hjältemodig insats. Trots att serien utspelar sig i en fiktiv värld utan allt för många fantastiska element - med viss verklighetsförankring - så tog sig skaparna en hög grad av artistisk frihet, inte minst vad gäller auditörernas arbetsuppgifter.

Allison Dubois kan kommunicera med de döda och hon har också en intuition om människor som gör att hon kan känna av personer som är sammanlänkande till brott. Med sin unika förmåga försöker Allison hjälpa rättsväsendet samtidigt som hon försöker få ihop vardagen med sin man Joe och deras barn.

Medan han kämpar för att rädda en ung tonåring, Ricky, från ett liv som gangster, blir Victor förälskad i pojkens temperamentsfulla storasyster Linda.